1) лингв. глубинная структура (смысл высказывания, который связывает различные поверхностные структуры и позволяет переходить от одной к другой)
See:
surface structure, transformational grammar
2) псих. глубинная структура (смысл высказывания, который не следует из произносимых слов, но подразумевается говорящим и оказывает влияние на его поведение)
See:
surface structure, Meta Model, reference structure