Первоначальное название проезда – Лесная улица – известно с 1887 года. Улица начиналась от Большой Объездной улицы (улица Орбели) севернее дома № 19, проходила по южному берегу Серебряного пруда, пересекала Институтский проспект, Болотную улицу и шла до Старопарголовского проспекта (проспект Тореза). 15 мая 1965 года наименование было упразднено, но на участке от улицы Орбели до Болотной улицы проезд продолжал существовать, и 17 мая 2006 года, одновременно с площадью Академика Лихачева, ему было присвоено название в честь Д. С. Лихачева, который жил рядом с этой аллеей, в доме № 34 по 2-му Муринскому проспекту.