Группа ферментов, осуществляющих превращение топологических изомеров ДНК друг в друга, контролируют уровень суперскрученности ДНК. По механизму действия ДНК-Т.Т. разделяют на два типа - ДНК-T.Т. I и ДНК-T.Т. II (см. DNA topoisomerase I, II и III DNA gyrase). Для внесения одноцепочечных разрывов в ДНК все ДНК-T.Т. используют остаток Tyr, который осуществляет нуклеофильную атаку фосфатной группы ДНК с образованием фосфотирозина, что сопровождается ковалентным связыванием фермента с 3'- или 5'-концами ДНК в одноцепочечном разрыве и, в свою очередь, исключает необходимость затараты энергии при восстановлении фосфодиэфирных связей в ДНК на заключительных этапах реакции.